公元前359年，商鞅向秦孝公进强国之言。陈说变法图强的道理，赢得了孝公的赞赏。他立即被命名为左庶长，商鞅开始了他的第一次政治改革。

这次变法主要有四个方面：一是实行户籍制度。根据新的法律，生者登记，死者注销，以控制农民和收税，五个家庭为一伍。十个家庭为一什，建立罪行的相互报告和同罪连坐。一个人犯了罪，如果为同一伍，同一什不告发或不检举与犯人同罪；告密者有奖。二、废除旧的贵族世袭制度，奖励军工，禁止私自斗殴。根据军工的大小封官加爵。不管是宗室还是贵族，如果没有军工，就会消除其贵族地位而不能享受相应的待遇。这一改革大大加强了国家权力的集中，同时也给旧贵族势力以沉重的打击，使许多旧贵族对他们怀恨在心。三、重农抑商，奖励耕织。商鞅把农业看作本业，把商业看作末业。他认为农业是国家繁荣和强盛的根本保证。因此，新法规定，那些生产更多食物和布料的人可以免除劳动和税收；放弃农业经商，懒惰的穷人，全家都是官府的奴婢。商鞅压制商业，以防止商人破坏小农经济。

新法实施几年后，秦国人民安居乐业。秦国取得了前所未有的经济、政治和军事发展，使原本落后的秦国，一跃成为六国的第一强国。

公元前352年（秦孝公十年），商鞅因其在政治改革方面的卓越成就升为大良造。相当于宰相。公元前350年，商鞅进行了第二次变法，进一步改革经济和政治。主要措施是有废井田，开阡陌。承认私有制，允许土地买卖，解除了良田制度对封建经济的阻碍；废除分封制，建立县治。全国的乡、邑合并为31个县，由国家直接派遣的官吏管理，建立了中央集权的政治制度，将国家的政治权力和军事权力集中到朝廷：统一计量，颁布度量衡标准，这成为后来秦始皇统一天下度量衡的基础和标准。

第二次政治改革后，秦国变得更加富裕和强大，称雄六国。但是改革后不久，旧贵族公子虔，故意违法乱纪，刁难商鞅。商鞅再一次无情地***旧贵族势力。割掉了公子虔的鼻子。两年后，魏军马陵之战失败，秦军乘机伐魏。商鞅写信假意邀请魏公子喝酒，魏公子如期到达，不料中了商鞅的计，大败，不得不将河西地归还秦国。

商的两次变法对当时的和后世都产生了深远的影响。后世的保甲制度是根据商鞅变法演变而来的，他的郡县制度也被后世所采用。