清政府只好解散皇族内阁，请袁世凯出山，任命他为内阁总理大臣，向他交出军政大权。袁世凯以帝国主义为后盾，挟北洋军队的实力，一面利用***声威，恫吓清政府，逼迫满族亲贵交出权力；-面又向***派威胁利诱，施加压力，迫使就范。袁世凯指挥北洋军进攻武汉时，同盟会领袖黄兴率领***军英勇抗击，但事权不一，力量悬殊，战斗失利。

北洋军占领汉口、汉阳，炮轰武昌。经过帝国主义的撮合，袁世凯又和***陈营试探和谈。早在孙中山回国以前，南北和谈已在上海进行，双方就停战、国体、召开国民会议等进行讨论。帝国主义支持袁世凯，压迫***派妥协。立宪派和有的同盟会员也向袁世凯靠拢，表示如果清帝退位，将拥护袁出任第一任大总统。

孙中山回国后，虽然反对妥协，积极主张北伐，组织了各路北伐军，但各军未经训练，编制互异，指挥不灵，遭到各方面反对和掣肘。面对***阵营的涣散状态和南北议和的既成事实，孙中山只能让步，另选袁世凯为正式大总统。袁世凯上奏隆裕太后，请召开皇族亲贵会议，速定方针。民国元年二月十二日，隆裕太后带着宣统小皇帝举行清王朝最后一次朝见仪式，接受优待皇室的条件，发布退位诏书。统治中国二百六十八年的清王朝宣告灭亡。